Motif clustering results by m2match
View clustering
Get FBPs
Merged motifs
oligos_7nt_mkv5_m2
FBP matrix
A
0.882 0.027 0.022 0.042 0.190 0.860 0.918
C
0.042 0.013 0.025 0.848 0.025 0.039 0.023
G
0.036 0.034 0.906 0.045 0.011 0.069 0.038
T
0.040 0.926 0.047 0.065 0.774 0.032 0.021
Motif logo
Merged motifs
oligos_7nt_mkv5_m3
FBP matrix
A
0.008 0.029 0.028 0.041 0.066 0.083 0.031
C
0.969 0.014 0.877 0.836 0.863 0.085 0.908
G
0.013 0.940 0.052 0.085 0.036 0.103 0.038
T
0.010 0.017 0.043 0.038 0.035 0.729 0.023
Motif logo
Merged motifs
positions_7nt_m4,positions_8nt_m3
FBP matrix
A
0.560 0.048 0.851 0.022 0.045 0.076 0.174 0.092 0.931 0.032 0.810 0.145
C
0.115 0.123 0.043 0.017 0.049 0.705 0.048 0.814 0.030 0.074 0.018 0.180
G
0.180 0.018 0.074 0.030 0.815 0.047 0.702 0.049 0.017 0.043 0.124 0.115
T
0.145 0.811 0.032 0.931 0.091 0.172 0.076 0.045 0.022 0.851 0.048 0.560
Motif logo
Merged motifs
oligos_7nt_mkv5_m4,positions_8nt_m4
FBP matrix
A
0.271 0.256 0.161 0.925 0.051 0.474 0.924 0.040 0.942 0.940 0.110
C
0.192 0.208 0.696 0.033 0.018 0.076 0.018 0.835 0.021 0.020 0.049
G
0.150 0.393 0.068 0.021 0.044 0.387 0.030 0.068 0.014 0.022 0.051
T
0.387 0.143 0.075 0.021 0.887 0.063 0.028 0.057 0.023 0.018 0.790
Motif logo
Merged motifs
positions_7nt_m1,positions_8nt_m2,local_words_7nt_m4,positions_8nt_m1,local_words_8nt_m1,local_words_8nt_m2,positions_7nt_m2,local_words_7nt_m1,local_words_7nt_m2,local_words_8nt_m3,oligos_7nt_mkv5_m1,local_words_7nt_m3
FBP matrix
A
0.556 0.142 0.539 0.050 0.089 0.120 0.502 0.123 0.826 0.037 0.050 0.073 0.846 0.500 0.785 0.180 0.162 0.636 0.640 0.184
C
0.188 0.356 0.090 0.066 0.041 0.376 0.055 0.131 0.044 0.022 0.031 0.773 0.021 0.057 0.032 0.079 0.359 0.137 0.125 0.118
G
0.123 0.094 0.078 0.052 0.299 0.411 0.066 0.064 0.043 0.018 0.840 0.038 0.037 0.094 0.118 0.101 0.291 0.106 0.121 0.180
T
0.133 0.408 0.293 0.832 0.571 0.093 0.377 0.682 0.087 0.923 0.079 0.116 0.096 0.349 0.065 0.640 0.188 0.121 0.114 0.518
Motif logo
Merged motifs
oligos_8nt_mkv6_m3,oligos_8nt_mkv6_m4,oligos_8nt_mkv6_m1,oligos_8nt_mkv6_m2
FBP matrix
A
0.155 0.182 0.032 0.055 0.014 0.457 0.018 0.022 0.034 0.026 0.111 0.293
C
0.345 0.231 0.897 0.035 0.931 0.097 0.122 0.550 0.894 0.036 0.477 0.207
G
0.207 0.470 0.043 0.877 0.034 0.135 0.408 0.411 0.039 0.907 0.266 0.344
T
0.293 0.117 0.028 0.033 0.021 0.311 0.452 0.017 0.033 0.031 0.146 0.156
Motif logo